酵母选择营养缺陷型培养基之选择性氨基酸混合物(DO Supplement)

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  • 2019年11月12日
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酵母选择营养缺陷培养基之:

选择性氨基酸混合物(Dropout Supplement, DO Supplement)

(单缺,双缺,三缺,四缺)

 

背景描述:

酵母菌的质粒筛选通常基于营养缺陷型突变菌株的使用而开展,这些菌株在缺乏某种特定培养基组分(比如氨基酸,嘌呤或嘧啶)的情况下无法生长。当转化含有突变基因的质粒后使得阳性转化克隆能够在缺乏必需营养组分的培养基内生长,正因如此,省却成分培养基添加剂/选择性氨基酸混合物(DO medium supplements)能用来筛选成功转化的酵母培养物。

 

选择性氨基酸混合物/氨基酸缺失混合物(DO medium supplements)同义名:

Yeast Media, Amino Acid Dropout Mixes

Yeast Synthetic Drop-out Medium Supplements

Complete Supplement Mixture (CSM)

Amino Acid Supplement (Drop-Out Mixture)

 

酵母营养缺陷型培养基:

酵母选择营养缺陷型培养基(Synthetic Dropout Media, SD Media)多用来营养缺陷型标记基因的筛选和酵母转化。这类培养基的配制根据商业化产品的区别有两种方式。

第一种方式:无氨基酸酵母氮源基础+葡萄糖+选择性氨基酸混合物(YNB without amino acids + glucose+ DO Supplement)

第二种方式:酵母基本培养基SD Base+选择性氨基酸混合物(Yeast Minimal Base——SD Base + DO Supplement)

【1】商业化SD Base与YNB的差别在于前者已添加葡萄糖。

【2】有研究显示,葡萄糖与氨基酸一起高压灭菌会发生化学反应,培养基会变色,由浅黄到深褐色不等,可能对细胞的生长产生一些影响,但一般情况下不会影响实验。因此,很多实验室经过验证或通过对自身实验体系的评估,还是倾向用【第二种方式】来配制选择性缺陷完全培养基。

【3】我司(懋康生物)建议客户根据自身需求来选择产品和配制培养基。

 

酵母营养缺陷型培养基工作原理:

特异的酵母营养缺陷培养基用于选择培养含特异载体的酵母或杂交筛选。其工作原理如下(以基于Matchmarker GAL4-based two hybrid assay系统用到的载体为例):

诱饵载体(pGBKT7-Bait)含合成色氨酸(Trp)的基因,诱捕载体(pGADT7-Prey)含合成亮氨酸(Leu)的基因。前者的亲代酵母菌株(如Y2HGold)本身不含Trp基因,在Trp缺失的培养基上无法生长。当诱饵载体(pGBKT7-Bait)成功转入Y2HGold,其在Trp缺失的培养基【即SD-Trp单缺培养基】上就能正常生长。同理,后者的亲代酵母菌株(如Y187)本身不含Leu基因,在Leu缺失的培养基上无法生长。但当诱捕载体(pGADT7-Prey)成功转入Y187,其在Leu缺失的培养基【即SD-Leu单缺培养基】上能正常生长。

选择性氨基酸混合物(DO medium supplements)类别和应用:

不管是第一种方式还是第二种方式配制的酵母选择营养缺陷型培养基(SD Media)配制的关键在于选择合适的选择性/缺陷型氨基酸混合物(DO supplement)来配制特定的培养基,从而满足特定的需求。如何选择合适的选择性氨基酸混合物,见表1。

根据氨基酸缺失数目分为单缺氨基酸混合物(Single Dropout Supplements,SDO),双缺氨基酸混合物(Double Dropout Supplements,DDO),以此类推。

主要应用:

1. 营养缺陷型表型的确认

2. 酵母转化阳性菌株的筛选

3. 酵母双杂交筛选

4. 酵母单杂交选择 

表1.选择性氨基酸混合物(DO medium supplements)类别和应用

类型 应用 名称 MKbio编号 Clontech编号
SDO(Single Dropout Supplements)(单缺) 外源基因在酵母中的表达、异源基因

功能互补、酵母单杂交系统和酵母双

杂交系统初始质粒转化

DO Supplement -His MS6316-10G 630415
DO Supplement -Leu MS6317-10G 630414
DO Supplement -Trp MS6318-10G 630413
DO Supplement -Ura MS6319-10G 630416
DDO(Double Dropout Supplements)

配制酵母选择营养缺陷

培养基的氨基酸混合物

(双缺)

外源基因在酵母中的表达、异源基因

功能互补、酵母单杂交系统和酵母双

杂交系统初始质粒转化免疫共沉淀、

Y187和AH109酵母交配实验、接合

型二倍体筛选

DO Supplement -His/-Leu MS6320-10G 630418
DO Supplement -His/-Ura MS6321-10G 630422
DO Supplement -Leu/-Trp MS6322-10G 630417
DO Supplement -Met/-Trp MS6323-10G 630431
DO Supplement -Trp/-Ura MS6324-10G 630427
DO Supplement -Trp/-His MS6325-10G /
DO Supplement -Ura/-Leu MS6326-10G /
TDO(Triple Dropout Supplements)

配制酵母选择营养缺陷

培养基的氨基酸混合物

(三缺)

外源基因在酵母中的表达、异源基因

功能互补、酵母单杂交系统和酵母双

杂交系统报告基因检测、Y187和AH109

酵母交配实验后报告基因分析(His3,Ade2)

DO Supplement -His/-Leu/-Trp MS6331-10G 630419
DO Supplement -His/-Leu/-Ura MS6332-10G 630423
DO Supplement -His/-Trp/-Ura MS6333-10G 630424
DO Supplement -Leu/-Met/-Trp MS6334-10G 630430
DO Supplement -Leu/-Trp/-Ura MS6335-10G 630426
DO Supplement -Trp/-His/-Ade MS6336-10G /
QDO(Quadruple Dropout Supplements)

配制酵母选择营养缺陷

培养基的氨基酸混合物

(四缺)

酵母双杂交系统和酵母三杂交系统报告

基因检测、Y187和AH109酵母交配实验后报告基因分析(His3,Ade2)

DO Supplement -Ade/-His/-Leu/-Trp MS6341-10G 630428
DO Supplement -His/-Leu/-Met/-Trp MS6342-10G 630429
DO Supplement -His/-Leu/-Trp/-Ura MS6343-10G 630425

选择性氨基酸混合物(DO medium supplements)订购信息:现货供应,性价比高,欢迎咨询。电话:021-54736159,QQ:2971634497。

品牌 名称 货号 规格              价格(元)     对应Clontech      
MKbio           DO Supplement -His MS6316-10G      10g 418 630415
MKbio DO Supplement -Leu MS6317-10G 10g 418 630414
MKbio DO Supplement -Trp MS6318-10G 10g 418 630413
MKbio DO Supplement -Ura MS6319-10G 10g 418 630416
MKbio DO Supplement -His/-Leu MS6320-10G 10g 418 630418
MKbio DO Supplement -His/-Ura MS6321-10G 10g 418 630422
MKbio DO Supplement -Leu/-Trp MS6322-10G 10g 418 630417
MKbio DO Supplement -Met/-Trp MS6323-10G 10g 418 630431
MKbio DO Supplement -Trp/-Ura MS6324-10G 10g 418 630427
MKbio DO Supplement -Trp/-His MS6325-10G 10g 418 /
MKbio DO Supplement -Ura/-Leu MS6326-10G 10g 418 /
MKbio DO Supplement -His/-Leu/-Trp MS6331-10G 10g 418 630419
MKbio DO Supplement -His/-Leu/-Ura MS6332-10G 10g 418 630423
MKbio DO Supplement -His/-Trp/-Ura MS6333-10G 10g 418 630424
MKbio DO Supplement -Leu/-Met/-Trp MS6334-10G 10g 418 630430
MKbio DO Supplement -Leu/-Trp/-Ura MS6335-10G 10g 418 630426
MKbio DO Supplement -Trp/-His/-Ade MS6336-10G 10g 418 /
MKbio DO Supplement -Ade/-His/-Leu/-Trp         MS6341-10G 10g 418 630428
MKbio DO Supplement -His/-Leu/-Met/-Trp           MS6342-10G         10g 418 630429
MKbio  DO Supplement -His/-Leu/-Trp/-Ura MS6343-10G 10g 418 630425

【重要消息】:

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类型 名称 货号 规格           价格(元)
SD + DO Broth酵母缺陷型完全培养基(肉汤) SD/-His Broth MS6361-5L     5L 838
SD/-Leu Broth MS6363-5L 5L 838
SD/-Trp Broth MS6365-5L 5L 838
SD/-Ura Broth MS6367-5L 5L 838
SD/-His/-Leu Broth MS6381-5L 5L 838
SD/-His/-Ura Broth MS6383-5L 5L 838
SD/-Leu/-Trp Broth MS6385-5L 5L 838
SD/-Met/-Trp Broth MS6387-5L 5L 838
SD/-Trp/-Ura Broth MS6389-5L 5L 838
SD/-Trp/-His Broth MS6391-5L 5L 838
SD/-Trp/-Ade Broth MS6393-5L 5L 838
SD/-Ura/-Leu Broth MS6395-5L 5L 838
SD/-His/-Leu/-Trp Broth MS6411-5L 5L 838
SD/-His/-Leu/-Ura Broth MS6413-5L 5L 838
SD/-His/-Trp/-Ura Broth MS6415-5L 5L 838
SD/-Leu/-Met/-Trp Broth MS6417-5L 5L 838
SD/-Leu/-Trp/-Ura Broth MS6419-5L 5L 838
SD/-Trp/-His/-Ade Broth MS6421-5L 5L 838
SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp Broth MS6431-5L 5L 838
SD/-His/-Leu/-Met/-Trp Broth MS6433-5L 5L 838
SD/-His/-Leu/-Trp/-Ura Broth MS6435-5L 5L 838
SD + DO with Agar酵母缺陷型完全培养基(琼脂) SD/-His with Agar MS6362-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Leu with Agar MS6364-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Trp with Agar MS6366-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Ura with Agar MS6368-5L 10×0.5 L 1078
SD/-His/-Leu with Agar MS6382-5L 10×0.5 L 1078
SD/-His/-Ura with Agar MS6384-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Leu/-Trp with Agar MS6386-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Met/-Trp with Agar MS6388-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Trp/-Ura with Agar MS6390-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Trp/-His with Agar MS6392-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Trp/-Ade with Agar MS6394-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Ura/-Leu with Agar MS6396-5L 10×0.5 L 1078
SD/-His/-Leu/-Trpwith Agar MS6412-5L 10×0.5 L 1078
SD/-His/-Leu/-Urawith Agar MS6414-5L 10×0.5 L 1078
SD/-His/-Trp/-Urawith Agar MS6416-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Leu/-Met/-Trpwith Agar MS6418-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Leu/-Trp/-Urawith Agar MS6420-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Trp/-His/-Adewith Agar MS6422-5L 10×0.5 L 1078
SD/-Ade/-His/-Leu/-Trpwith Agar MS6432-5L 10×0.5 L 1078
SD/-His/-Leu/-Met/-Trpwith Agar MS6434-5L 10×0.5 L 1078
SD/-His/-Leu/-Trp/-Urawith Agar MS6436-5L 10×0.5 L 1078

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 — —Written/Edited by V. Shallan【版权归集奇生物/MKBio懋康所有】